(1) valg av utstyr. Det er noen problemer ved valg av farmasøytisk utstyr, som valg basert på erfaring (uten faktisk beregning eller utilstrekkelig databeregning), blind jakt på fremskritt og utilstrekkelig undersøkelse av fysiske data, noe som i alvorlig grad påvirker utstyrets praktiske anvendelighet og økonomi.

(2) installasjon og opplæring av utstyr. I prosessen med installasjon av farmasøytisk utstyr blir det ofte lagt vekt på byggeprosessen, mens man ignorerer byggekvaliteten, noe som fører til økte vedlikeholdskostnader for utstyr senere. I tillegg utgjør utilstrekkelig opplæring av personell for vedlikehold og drift av utstyr også en risiko for administrasjon og vedlikehold av farmasøytisk utstyr.

(3) utilstrekkelig investering i administrasjon og vedlikehold av informatisering. Selv om mange bedrifter i dag legger stor vekt på administrasjon og vedlikehold av utstyr, samt administrasjon av vedlikeholdsjournaler og registrering av grunnleggende parametere for utstyr, finnes det fortsatt problemer, som vanskeligheter med å levere kontinuerlig vedlikeholdsdata og mangel på effektiv spesifikasjonsinformasjon for farmasøytisk utstyr, som spesifikasjoner, tegninger osv. Dette øker vanskeligheten med administrasjon, vedlikehold og ombygging av utstyr.

(4) styringssystem. Mangel på effektive styringssystemer og -metoder fører til utilstrekkelig styring av vedlikeholdspersonell for farmasøytisk utstyr, mangel på standardisering av vedlikeholdspersonellets arbeid, og prosessen med styring og vedlikehold av farmasøytisk utstyr etterlater sikkerhetsfarer som skjulte sikkerheter.